信用评级机构可以通过以下方式来应对企业内部管理问题：
加强内部审核：评级机构可以加强对企业内部管理机制的审核，包括财务报表真实性、风险管理措施等方面的审查，以确保企业管理水平符合评级标准。
性和透明度：评级机构应确保评级过程的性和透明度，避免受到企业内部管理人员的影响，公开评级标准和方法，提高评级结果的可信度。
提供建议和改进建议：评级机构可以向企业提供关于内部管理的建议，指出存在的问题并提出改进意见，帮助企业提升管理水平。
风险警示：评级机构可以在评级报告中明确标注企业内部管理存在的风险，提醒投资者注意，帮助投资者做出明智的决策。
案例分析：评级机构可以通过案例分析的方式，向企业展示优秀企业管理实践，帮助企业学习借鉴，提升内部管理水平。
通过以上方式，评级机构可以帮助企业更好地应对内部管理问题，提升企业管理水平，增强投资者信心。